Jan Gorodkin

Jan Gorodkin

Professor

Medlem af:


    Udgivelsesår:
    Alle
    126 - 150 ud af 151Pr. side: 25
    Sortering: Titel
    1. Udgivet

      The developing Entorhinal Cortex – a cellular map

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Pfisterer, U. G., Asenjo Martinez, A., Seemann, Ernst Stefan, Pihl, M., Thomsen, Preben Dybdahl, Hyttel, P., witter, M., Khodosevich, Konstantin, Gorodkin, Jan, Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 2019.

      Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

    2. Udgivet

      The developing Entorhinal cortex - a cellular map

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Pfisterer, U. G., Handfield, L., Asenjo Martinez, A., Seemann, Ernst Stefan, Witter, M., Khodosevich, Konstantin, Gorodkin, Jan, Hemberg, M., Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 25 nov. 2019. 1 s.

      Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Formidling

    3. Udgivet

      The developmental neurogenic niche of the Entorhinal cortex revealed by single-cell transcriptomics.

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Peralvo Vidal, Juan Miguel, Mori, Yuki, Seemann, Ernst Stefan, Pihl, M., Thomsen, Preben Dybdahl, Hyttel, P., witter, M., Gorodkin, Jan, Hall, Vanessa Jane & Pers, Tune H, 2018.

      Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

    4. Udgivet

      The identification and functional annotation of RNA structures conserved in vertebrates

      Seemann, Ernst Stefan, Mirza, A. H., Hansen, C., Bang-Berthelsen, C. H., Garde, C., Christensen-Dalsgaard, M., Torarinsson, E., Yao, Z., Workman, C. T., Pociot, Flemming, Nielsen, Henrik, Tommerup, Niels, Ruzzo, W. L. & Gorodkin, Jan, 2017, I: Genome Research. 27, s. 1371-1383 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    5. Udgivet

      The impact of PrsA over-expression on the Bacillus subtilis transcriptome during fed-batch fermentation of alpha-amylase production

      Geissler, Adrian Sven, Poulsen, L. D., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Anthon, Christian, Seemann, Ernst Stefan, González-Tortuero, E., Breüner, A., Jensen, Lars Juhl, Hjort, C., Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 17 s., 909493.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    6. Udgivet

      The tedious task of finding homologous noncoding RNA genes

      Menzel, K. P., Gorodkin, Jan & Stadler, P. F., 2009, I: RNA: A publication of the RNA Society. 15, 12, s. 2075-2082 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    7. Udgivet

      The tmRDB and SRPDB resources

      Andersen, E. S., Rosenblad, M. A., Larsen, N., Westergaard, Jesper Cairo, Burks, J., Wower, I. K., Wower, J., Gorodkin, Jan, Samuelsson, T. & Zwieb, C., 2006, I: Nucleic Acids Research. 34, s. D163-D168 6 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    8. Udgivet

      The transcriptomic landscape of neurons carrying PSEN1 mutations reveals changes in extracellular matrix components and non-coding gene expression

      Corsi, G. I., Gadekar, V. P., Haukedal, H., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Anthon, Christian, Ambardar, S., Palakodeti, D., Hyttel, P., Freude, Kristine, Seemann, Ernst Stefan & Gorodkin, Jan, 2023, I: Neurobiology of Disease. 178, 17 s., 105980.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    9. Udgivet

      Thousands of corresponding human and mouse genomic regions unalignable in primary sequence contain common RNA structure

      Torarinsson, E., Sawera, M., Havgaard, Jakob Hull, Fredholm, Merete & Gorodkin, Jan, 2006, I: Genome Research. 16, 7, s. 885-889 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    10. Udgivet

      Transcriptome landscape of protein-coding genes and long noncoding RNAs in the colon and blood of DSS-induced mouse model of Acute ulcerative colitis

      Yarani, R., Palasca, Oana, Doncheva, Nadezhda Tsankova, Anthon, Christian, Pilecki, B., Litman, Thomas, Holmskov, U., Jensen, Lars Juhl, Gorodkin, Jan & Pociot, Flemming, 2019, I: Journal of Crohn's and Colitis. 13, s. S129-S130

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt

    11. Udgivet

      Transcriptome-wide analysis of UTRs in non-small cell lung cancer reveals cancer-related genes with SNV-induced changes on RNA secondary structure and miRNA target sites

      Radhakrishnan, S., Wenzel, Anne, Novotny, P., Tang, X., Kalari, K. R. & Gorodkin, Jan, 2014, I: P L o S One. 9, 1, 16 s., e82699.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    12. Udgivet

      Transcriptomic landscape of lncRNAs in inflammatory bowel disease

      Mirza, A. H., Bang-Berthelsen, C. H., Seemann, Ernst Stefan, Pan, X., Frederiksen, K. S., Vilien, M., Gorodkin, Jan & Pociot, Flemming, 2015, I: Genome Medicine. 7, 22 s., 39.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    13. Udgivet

      Transcripts with in silico predicted RNA structure are enriched everywhere in the mouse brain

      Seemann, Ernst Stefan, Sunkin, S. M., Hawrylycz, M. J., Ruzzo, W. L. & Gorodkin, Jan, 2012, I: BMC Genomics. 13, 1, s. 214-227 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    14. Udgivet

      Translational co-regulation of a ligand and inhibitor by a conserved RNA element

      Zaucker, A., Nagorska, A., Kumari, P., Hecker, N., Wang, Y., Huang, S., Cooper, L., Sivashanmugam, L., VijayKumar, S., Brosens, J., Gorodkin, Jan & Sampath, K., jan. 2018, I: Nucleic Acids Research. 46, 1, s. 104–119

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    15. Udgivet

      Translational control of furina by an RNA regulon is important for left-right patterning, heart morphogenesis and cardiac valve function

      Nagorska, A., Zaucker, A., Lambert, F., Inman, A., Toral-Perez, S., Gorodkin, Jan, Wan, Y., Smutny, M. & Sampath, K., 2023, I: Development (Cambridge). 150, 23, 15 s., 201657.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    16. Udgivet

      Uncovering the anatomical and molecular landscape of the developing entorhinal cortex.

      Liu, Y., Bergmann, T. B., Peralvo Vidal, Juan Miguel, Lee, J., Mori, Yuki, Seemann, Ernst Stefan, Pihl, M., Thomsen, Preben Dybdahl, Gorodkin, Jan, Hyttel, P., Pers, Tune H, witter, M. & Hall, Vanessa Jane, 2018.

      Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

    17. Udgivet

      Uncovering the anatomical and molecular landscape of the starting point of Alzheimer’s disease in the brain

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Pfisterer, U. G., Asenjo Martinez, A., Seemann, Ernst Stefan, Pihl, M., Thomsen, Preben Dybdahl, Hyttel, P., witter, M., Khodosevich, Konstantin, Gorodkin, Jan, Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 2019.

      Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

    18. Udgivet

      Unifying evolutionary and thermodynamic information for RNA folding of multiple alignments

      Seemann, Ernst Stefan, Gorodkin, Jan & Backofen, R., 2008, I: Nucleic Acids Research. 36, 20, s. 6355-6362 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    19. Udgivet

      Using GPU to accelerate the pairwise structural RNA alignment with base pair probabilities

      Sundfeld, D., Teodoro, G., Havgaard, Jakob Hull, Gorodkin, Jan & Melo, A. C. M. A., 2020, I: Concurrency Computation. 32, 10, e5468.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    20. Udgivet

      Utilization of ESTs from Cassava: Progress on Development of EST-SSR Markers and an Oligo DNA Microarray

      Ingelbrecht, I. L., Jørgensen, Kirsten, Bak, Søren, Gorodkin, Jan, Raji, A., Winter, S., Lokko, Y., Gedil, M., Anderson, J. V. & Møller, Birger Lindberg, 2008.

      Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

    21. Udgivet

      Utilizing directed evolution to interrogate and optimize CRISPR/Cas guide RNA scaffolds

      Bush, K., Corsi, G. I., Yan, A. C., Haynes, K., Layzer, J. M., Zhou, J. H., Llanga, T., Gorodkin, Jan & Sullenger, B. A., 2023, I: Cell Chemical Biology. 30, 8, s. 879-892.e5

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    22. Udgivet

      Warburg Effect Metabolism Drives Neoplasia in a Drosophila Genetic Model of Epithelial Cancer

      Eichenlaub, T., Villadsen, René, Freitas, F. C. P., Andrejeva, Diana, Aldana, Blanca, Nguyen, H. T., Petersen, Ole William, Gorodkin, Jan, Herranz, Hector & Cohen, S. M., 2018, I: Current Biology. 28, 20, s. 3220-3228.e6

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    23. Udgivet

      WebCircRNA: Classifying the Circular RNA Potential of Coding and Noncoding RNA.

      Pan, X., Xiong, K., Anthon, Christian, Hyttel, P., Freude, Kristine, Jensen, Lars Juhl & Gorodkin, Jan, 6 nov. 2018, I: Genes. 9, 11, 11 s., 536.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    24. Udgivet

      iPSC-derived Microglia for Disease Modeling of Frontotemporal Dementia 3

      Haukedal, H., Freude, Kristine, Garcia, B. A., Corsi, G., Gadekar, V. & Gorodkin, Jan, 2021, I: Glia. 69, S1, s. E480-E481 T14-066D.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Konferenceabstrakt i tidsskrift › Forskning › fagfællebedømt

    25. Udgivet

      maxAlike: maximum likelihood-based sequence reconstruction with application to improved primer design for unknown sequences

      Menzel, K. P., Stadler, P. F. & Gorodkin, Jan, 2011, I: Bioinformatics. 27, 3, s. 317-325 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    Forrige 12 3 4 5 6 7 Næste

    ID: 4356276