Ernst Stefan Seemann

Ernst Stefan Seemann

Lektor

Medlem af:


    1. Udgivet

      Prediction of structured non-coding RNAs, RNA-RNA interactions and their (co)-expression in the brain

      Seemann, Ernst Stefan, 2010, Department of Basic Animal and Veterinary Sciences, University of Copenhagen. 195 s.

      Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapportPh.d.-afhandlingForskning

    2. Udgivet

      Transcripts with in silico predicted RNA structure are enriched everywhere in the mouse brain

      Seemann, Ernst Stefan, Sunkin, S. M., Hawrylycz, M. J., Ruzzo, W. L. & Gorodkin, Jan, 2012, I: BMC Genomics. 13, 1, s. 214-227 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. Udgivet

      The identification and functional annotation of RNA structures conserved in vertebrates

      Seemann, Ernst Stefan, Mirza, A. H., Hansen, C., Bang-Berthelsen, C. H., Garde, C., Christensen-Dalsgaard, M., Torarinsson, E., Yao, Z., Workman, C. T., Pociot, Flemming, Nielsen, Henrik, Tommerup, Niels, Ruzzo, W. L. & Gorodkin, Jan, 2017, I: Genome Research. 27, s. 1371-1383 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    4. Udgivet

      Quality Assessment of Domesticated Animal Genome Assemblies

      Seemann, Ernst Stefan, Anthon, Christian, Palasca, Oana & Gorodkin, Jan, 2015, I: Bioinformatics and Biology Insights. 9, Suppl 4, s. 49-58 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    5. Udgivet

      Does rapid sequence divergence preclude RNA structure conservation in vertebrates?

      Seemann, Ernst Stefan, Mirza, A. H., Bang-Berthelsen, C. H., Garde, C., Christensen-Dalsgaard, M., Workman, C. T., Pociot, Flemming, Tommerup, Niels, Gorodkin, Jan & Ruzzo, W. L., 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 5, s. 2452-2463 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    6. Udgivet

      Modelling Nonalcoholic Steatohepatitis In Vivo—A Close Transcriptomic Similarity Supports the Guinea Pig Disease Model

      Skat-Rørdam, Josephine, Ipsen, David Højland, Seemann, Ernst Stefan, Latta, M., Lykkesfeldt, Jens & Tveden-Nyborg, Pernille, 2021, I: Biomedicines. 9, 9, 18 s., 1198.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. Udgivet

      Modelling nonalcoholic steatohepatitis in vivo—a close transcriptomic similarity supports the guinea pig disease model

      Skat-Rørdam, Josephine, Ipsen, David Højland, Seemann, Ernst Stefan, Latta, M., Lykkesfeldt, Jens & Tveden-Nyborg, Pernille, sep. 2021, I: Biomedicines. 9, 9, 1198.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    8. Udgivet

      DotAligner: Identification and clustering of RNA structure motifs

      Smith, M. A., Seemann, Ernst Stefan, Quek, X. C. & Mattick, J. S., dec. 2017, I: Genome Biology. 18, 1, 12 s., 244.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    9. Udgivet

      RNAcentral 2021: Secondary structure integration, improved sequence search and new member databases

      Sweeney, B. A., Petrov, A. I., Ribas, C. E., Finn, R. D., Bateman, A., Szymanski, M., Karlowski, W. M., Seemann, S. E., Gorodkin, J., Cannone, J. J., Gutell, R. R., Kay, S., Marygold, S., Dos Santos, G., Frankish, A., Mudge, J. M., Barshir, R., Fishilevich, S., Chan, P. P., Lowe, T. M. & 26 flere, Seal, R., Bruford, E., Panni, S., Porras, P., Karagkouni, D., Hatzigeorgiou, A. G., Ma, L., Zhang, Z., Volders, P. J., Mestdagh, P., Griffiths-Jones, S., Fromm, B., Peterson, K. J., Kalvari, I., Nawrocki, E. P., Petrov, A. S., Weng, S., Bouchard-Bourelle, P., Scott, M., Lui, L. M., Hoksza, D., Lovering, R. C., Kramarz, B., Mani, P., Ramachandran, S. & Weinberg, Z., 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, D1, s. D212-D220

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    10. Udgivet

      Full-length RNA structure prediction of the HIV-1 genome reveals a conserved core domain

      Sükösd, Z., Andersen, E. S., Seemann, Ernst Stefan, Jensen, M. K., Hansen, M., Gorodkin, Jan & Kjems, J., 2 dec. 2015, I: Nucleic Acids Research. 43, 21, s. 10168-79 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    ID: 4223622