Ernst Stefan Seemann

Ernst Stefan Seemann

Lektor

Medlem af:


    1. 2017
    2. Udgivet

      RNAscClust: Clustering RNA sequences using structure conservation and graph based motifs

      Miladi, M., Junge, A., Costa, F., Seemann, Ernst Stefan, Havgaard, Jakob Hull, Gorodkin, Jan & Backofen, R., 2017, I: Bioinformatics. 33, 14, s. 2089-2096 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. Udgivet

      The identification and functional annotation of RNA structures conserved in vertebrates

      Seemann, Ernst Stefan, Mirza, A. H., Hansen, C., Bang-Berthelsen, C. H., Garde, C., Christensen-Dalsgaard, M., Torarinsson, E., Yao, Z., Workman, C. T., Pociot, Flemming, Nielsen, Henrik, Tommerup, Niels, Ruzzo, W. L. & Gorodkin, Jan, 2017, I: Genome Research. 27, s. 1371-1383 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    4. 2016
    5. Udgivet

      SNHG5 promotes colorectal cancer cell survival by counteracting STAU1-mediated mRNA destabilization

      Damas, N. D., Marcatti, M., Côme, Christophe Roger Michel, Christensen, L., Nielsen, M. M., Baumgartner, R., Gylling, H. M., Maglieri, G., Friis, Carsten, Seemann, Ernst Stefan, Rapin, N., Thézenas, S., Vang, S., Ørntoft, T., Andersen, C. L., Pedersen, J. S. & Lund, Anders H., 22 dec. 2016, I: Nature Communications. 7, 14 s., 13875.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    6. Udgivet

      Differential transcriptional responses to Ebola and Marburg virus infection in bat and human cells: [Plus] Corrigendum

      Hölzer, M., Krähling, V., Amman, F., Barth, E., Bernhart, S. H., Carmelo, V. A. O., Collatz, M., Doose, G., Eggenhofer, F., Ewald, J., Fallmann, J., Feldhahn, L. M., Fricke, M., Gebauer, J., Gruber, A. J., Hufsky, F., Indrischek, H., Kanton, S., Linde, J., Mostajo, N. & 19 flere, Ochsenreiter, R., Riege, K., Rivarola-Duarte, L., Sahyoun, A. H., Saunders, S. J., Seemann, Ernst Stefan, Tanzer, A., Vogel, B., Wehner, S., Wolfinger, M. T., Backofen, R., Gorodkin, Jan, Grosse, I., Hofacker, I., Hoffmann, S., Kaleta, C., Stadler, P. F., Becker, S. & Marz, M., 7 okt. 2016, I: Scientific Reports. 6, 16 s., 34589.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. 2015
    8. Udgivet

      Full-length RNA structure prediction of the HIV-1 genome reveals a conserved core domain

      Sükösd, Z., Andersen, E. S., Seemann, Ernst Stefan, Jensen, M. K., Hansen, M., Gorodkin, Jan & Kjems, J., 2 dec. 2015, I: Nucleic Acids Research. 43, 21, s. 10168-79 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    9. Udgivet

      Emerging tools for RNA structure analysis in polymorphic data

      Radhakrishnan, S., Seemann, Ernst Stefan & Gorodkin, Jan, 2015, I: Biozoom. 2, s. 10-13 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

    10. Udgivet

      Optimizing RNA structures by sequence extensions using RNAcop

      Hecker, N., Christensen-Dalsgaard, M., Seemann, Ernst Stefan, Havgaard, Jakob Hull, Stadler, P. F., Hofacker, I. L., Nielsen, Henrik & Gorodkin, Jan, 2015, I: Nucleic Acids Research. 43, 17, s. 8135-8145 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    11. Udgivet

      Quality Assessment of Domesticated Animal Genome Assemblies

      Seemann, Ernst Stefan, Anthon, Christian, Palasca, Oana & Gorodkin, Jan, 2015, I: Bioinformatics and Biology Insights. 9, Suppl 4, s. 49-58 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    12. Udgivet

      Transcriptomic landscape of lncRNAs in inflammatory bowel disease

      Mirza, A. H., Bang-Berthelsen, C. H., Seemann, Ernst Stefan, Pan, X., Frederiksen, K. S., Vilien, M., Gorodkin, Jan & Pociot, Flemming, 2015, I: Genome Medicine. 7, 22 s., 39.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    13. 2014
    14. Udgivet

      Structured RNAs and synteny regions in the pig genome

      Anthon, Christian, Tafer, H., Havgaard, Jakob Hull, Thomsen, B., Hedegaard, J., Seemann, Ernst Stefan, Pundhir, Sachin, Kehr, S., Bartschat, S., Nielsen, M., Nielsen, R. O., Fredholm, Merete, Stadler, P. F. & Gorodkin, Jan, 2014, I: BMC Genomics. 15, 27 s., 459.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    ID: 4223622