Ernst Stefan Seemann

Ernst Stefan Seemann

Lektor

Medlem af:


    1. 2023
    2. Udgivet

      Alteration of microglial metabolism and inflammatory profile contributes to neurotoxicity in a hiPSC-derived microglia model of frontotemporal dementia 3

      Haukedal, H., Syshøj Lorenzen, S., Westi, Emil Winther, Corsi, G., Gadekar, V. P., McQuade, A., Davtyan, H., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Schmid, B., Chandrasekaran, Abinaya, Seemann, Ernst Stefan, Cirera, Susanna, Blurton-Jones, M., Meyer, M., Gorodkin, Jan, Aldana, Blanca & Freude, Kristine, 2023, I: Brain, Behavior, and Immunity. 113, s. 353-373

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    3. Udgivet

      CRISPRi screen for enhancing heterologous alpha-amylase yield in Bacillus subtilis

      Geissler, Adrian Sven, Fehler, A. O., Poulsen, L. D., Gonzalez-Tortuero, E., Kallehauge, T. B., Alkan, F., Anthon, Christian, Seemann, Ernst Stefan, Rasmussen, M. D., Breuener, A., Hjort, C., Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2023, I: Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. 50, 1, 16 s., kuac028.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    4. Udgivet

      Progress and harmonization of gene editing to treat human diseases: Proceeding of COST Action CA21113 GenE-HumDi

      Cavazza, A., Hendel, A., Bak, R. O., Rio, P., Güell, M., Lainšček, D., Arechavala-Gomeza, V., Peng, L., Hapil, F. Z., Harvey, J., Ortega, F. G., Gonzalez-Martinez, C., Lederer, C. W., Mikkelsen, K., Gasiunas, G., Kalter, N., Gonçalves, M. A. F. V., Petersen, J., Garanto, A., Montoliu, L. & 20 flere, Maresca, M., Seemann, Ernst Stefan, Gorodkin, Jan, Mazini, L., Sanchez, R., Rodriguez-Madoz, J. R., Maldonado-Pérez, N., Laura, T., Schmueck-Henneresse, M., Maccalli, C., Grünewald, J., Carmona, G., Kachamakova-Trojanowska, N., Miccio, A., Martin, F., Turchiano, G., Cathomen, T., Luo, Y., Tsai, S. Q. & Benabdellah, K., 2023, I: Molecular Therapy Nucleic Acids. 34, 14 s., 102066.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

    5. Udgivet

      RNA-Seq Study on the Longissimus thoracis Muscle of Italian Large White Pigs Fed Extruded Linseed with or without Antioxidants and Polyphenols

      Vegni, J., Sun, Y., Seemann, Ernst Stefan, Zappaterra, M., Davoli, R., Dall’Olio, S., Gorodkin, Jan & Zambonelli, P., 2023, I: Animals. 13, 7, 1187.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    6. Udgivet

      The transcriptomic landscape of neurons carrying PSEN1 mutations reveals changes in extracellular matrix components and non-coding gene expression

      Corsi, G. I., Gadekar, V. P., Haukedal, H., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Anthon, Christian, Ambardar, S., Palakodeti, D., Hyttel, P., Freude, Kristine, Seemann, Ernst Stefan & Gorodkin, Jan, 2023, I: Neurobiology of Disease. 178, 17 s., 105980.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    7. 2022
    8. Udgivet
    9. Udgivet

      CRISPRroots: On-and off-target assessment of RNA-seq data in CRISPR-Cas9 edited cells

      Corsi, G. I., Gadekar, V. P., Gorodkin, Jan & Seemann, Ernst Stefan, 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 4, 12 s., E20.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    10. Udgivet

      Does rapid sequence divergence preclude RNA structure conservation in vertebrates?

      Seemann, Ernst Stefan, Mirza, A. H., Bang-Berthelsen, C. H., Garde, C., Christensen-Dalsgaard, M., Workman, C. T., Pociot, Flemming, Tommerup, Niels, Gorodkin, Jan & Ruzzo, W. L., 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 5, s. 2452-2463 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    11. Udgivet

      Flagella disruption in Bacillus subtilis increases amylase production yield

      Fehler, A. O., Kallehauge, T. B., Geissler, Adrian Sven, González-Tortuero, E., Seemann, Ernst Stefan, Gorodkin, Jan & Vinther, Jeppe, 2022, I: Microbial Cell Factories. 21, 11 s., 131.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    12. Udgivet

      Production of human entorhinal stellate cell-like cells by forward programming shows an important role of Foxp1 in reprogramming

      Bergmann, T., Liu, Y., Skov, J., Mogus, L., Lee, J., Pfisterer, U., Handfield, L. F., Asenjo-Martinez, A., Lisa-Vargas, I., Seemann, S. E., Lee, J. T. H., Patikas, N., Kornum, B. R., Denham, M., Hyttel, P., Witter, M. P., Gorodkin, J., Pers, T. H., Hemberg, M., Khodosevich, K. & 1 flere, Hall, Vanessa Jane, 2022, I: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 10, 976549.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    13. Udgivet

      The Bacillaceae-1 RNA motif comprises two distinct classes

      González-Tortuero, E., Anthon, Christian, Havgaard, Jakob Hull, Geissler, Adrian Sven, Breüner, A., Hjort, C., Gorodkin, Jan & Seemann, Ernst Stefan, 2022, I: Gene. 841, 146756.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    14. Udgivet

      The impact of PrsA over-expression on the Bacillus subtilis transcriptome during fed-batch fermentation of alpha-amylase production

      Geissler, Adrian Sven, Poulsen, L. D., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Anthon, Christian, Seemann, Ernst Stefan, González-Tortuero, E., Breüner, A., Jensen, Lars Juhl, Hjort, C., Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 17 s., 909493.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    15. 2021
    16. Udgivet

      Bsgatlas: A unified bacillus subtilis genome and transcriptome annotation atlas with enhanced information access

      Geissler, Adrian Sven, Anthon, Christian, Alkan, F., González-Tortuero, E., Poulsen, L. D., Kallehauge, T. B., Breüner, A., Seemann, Ernst Stefan, Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2021, I: Microbial Genomics. 7, 2, 17 s., 000524.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    17. Udgivet

      Development of the entorhinal cortex occurs via parallel lamination during neurogenesis

      Liu, Y., Bergmann, T., Mori, Yuki, Peralvo Vidal, Juan Miguel, Pihl, M., Vasistha, Navneet A, Thomsen, Preben Dybdahl, Seemann, Ernst Stefan, Gorodkin, Jan, Hyttel, P., Khodosevich, Konstantin, Witter, M. P. & Hall, Vanessa Jane, 2021, I: Frontiers in Neuroanatomy. 15, 19 s., 663667.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    18. Udgivet

      Modelling Nonalcoholic Steatohepatitis In Vivo—A Close Transcriptomic Similarity Supports the Guinea Pig Disease Model

      Skat-Rørdam, Josephine, Ipsen, David Højland, Seemann, Ernst Stefan, Latta, M., Lykkesfeldt, Jens & Tveden-Nyborg, Pernille, 2021, I: Biomedicines. 9, 9, 18 s., 1198.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    19. Udgivet

      RNAcentral 2021: Secondary structure integration, improved sequence search and new member databases

      Sweeney, B. A., Petrov, A. I., Ribas, C. E., Finn, R. D., Bateman, A., Szymanski, M., Karlowski, W. M., Seemann, S. E., Gorodkin, J., Cannone, J. J., Gutell, R. R., Kay, S., Marygold, S., Dos Santos, G., Frankish, A., Mudge, J. M., Barshir, R., Fishilevich, S., Chan, P. P., Lowe, T. M. & 26 flere, Seal, R., Bruford, E., Panni, S., Porras, P., Karagkouni, D., Hatzigeorgiou, A. G., Ma, L., Zhang, Z., Volders, P. J., Mestdagh, P., Griffiths-Jones, S., Fromm, B., Peterson, K. J., Kalvari, I., Nawrocki, E. P., Petrov, A. S., Weng, S., Bouchard-Bourelle, P., Scott, M., Lui, L. M., Hoksza, D., Lovering, R. C., Kramarz, B., Mani, P., Ramachandran, S. & Weinberg, Z., 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, D1, s. D212-D220

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    20. Udgivet

      The canine activated platelet secretome (CAPS): A translational model of thrombin-evoked platelet activation response

      Cremer, Signe Emilie, Catalfamo, J. L., Goggs, R., Seemann, Ernst Stefan, Kristensen, Annemarie T., Szklanna, P. B., Maguire, P. B. & Brooks, M. B., 2021, I: Research and Practice in Thrombosis and Haemostasis. 5, 1, s. 55-68

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    21. 2019
    22. Udgivet

      The developing Entorhinal cortex - a cellular map

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Pfisterer, U. G., Handfield, L., Asenjo Martinez, A., Seemann, Ernst Stefan, Witter, M., Khodosevich, Konstantin, Gorodkin, Jan, Hemberg, M., Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 25 nov. 2019. 1 s.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceFormidling

    23. Udgivet

      Production of stellate cells from induced pluripotent stem cells to study Alzheimer's disease pathology

      Mogus, L., Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Pfisterer, U. G., Handfield, L., Asenjo Martinez, A., Seemann, Ernst Stefan, Witter, M., Khodosevich, Konstantin, Gorodkin, Jan, Hemberg, M., Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 2019. 1 s.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceFormidling

    24. Udgivet

      Proteomic profiling of the thrombin-activated canine platelet secretome (CAPS)

      Cremer, Signe Emilie, Catalfamo, J. L., Goggs, R., Seemann, Ernst Stefan, Kristensen, Annemarie T. & Brooks, M. B., 2019, I: PLoS ONE. 14, 11, e0224891.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    25. Udgivet

      RNAcentral: a hub of information for non-coding RNA sequences

      The RNAcentral Constortium , T., Gorodkin, Jan & Seemann, Ernst Stefan, 2019, I: Nucleic Acids Research. 47, D1, s. D221–D229

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    26. Udgivet

      Sandwich cortial lamination and single-cell analysis decodes the developing spatial processing system

      Liu, Y., Bergmann, T. B., Lee, J., Pfisterer, U. G., Handfield, L-F., Mori, Y., Asenjo Martinez, A., Lisa Vargas, I., Seemann, E. S., Lee, J. T. H., Patikis, N., Peralvo Vidal, J. M., Pihl, M., Kornum, B. R., Thomsen, P. D., Hyttel, P., Witter, M., Khodosevich, K., Gorodkin, J., Hemberg, M. & 2 flere, Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 2019. 45 s.

      Publikation: KonferencebidragPaperFormidling

    27. Udgivet

      The developing Entorhinal Cortex – a cellular map

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Pfisterer, U. G., Asenjo Martinez, A., Seemann, Ernst Stefan, Pihl, M., Thomsen, Preben Dybdahl, Hyttel, P., witter, M., Khodosevich, Konstantin, Gorodkin, Jan, Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 2019.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    28. Udgivet

      Uncovering the anatomical and molecular landscape of the starting point of Alzheimer’s disease in the brain

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Pfisterer, U. G., Asenjo Martinez, A., Seemann, Ernst Stefan, Pihl, M., Thomsen, Preben Dybdahl, Hyttel, P., witter, M., Khodosevich, Konstantin, Gorodkin, Jan, Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 2019.

      Publikation: KonferencebidragKonferenceabstrakt til konferenceForskning

    29. 2018
    30. Udgivet

      Multiple Sequence Alignments Enhance Boundary Definition of RNA Structures

      Sabarinathan, R., Anthon, Christian, Gorodkin, Jan & Seemann, Ernst Stefan, 4 dec. 2018, I: Genes. 9, 12, 17 s., 604.

      Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

    Forrige 1 2 3 Næste

    ID: 4223622