Ernst Stefan Seemann

Ernst Stefan Seemann

Lektor

Medlem af:

    ORCID: 0000-0002-2359-4927

    Udgivelsesår:
    Alle
    1 - 50 ud af 51Pr. side: 50
    Sortering: Udgivelsesdato
    1. 2023
    2. Udgivet

      Alteration of microglial metabolism and inflammatory profile contributes to neurotoxicity in a hiPSC-derived microglia model of frontotemporal dementia 3

      Haukedal, H., Syshøj Lorenzen, S., Westi, Emil Winther, Corsi, G., Gadekar, V. P., McQuade, A., Davtyan, H., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Schmid, B., Chandrasekaran, Abinaya, Seemann, Ernst Stefan, Cirera, Susanna, Blurton-Jones, M., Meyer, M., Gorodkin, Jan, Aldana, Blanca & Freude, Kristine, 2023, I: Brain, Behavior, and Immunity. 113, s. 353-373

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    3. Udgivet

      CRISPRi screen for enhancing heterologous alpha-amylase yield in Bacillus subtilis

      Geissler, Adrian Sven, Fehler, A. O., Poulsen, L. D., Gonzalez-Tortuero, E., Kallehauge, T. B., Alkan, F., Anthon, Christian, Seemann, Ernst Stefan, Rasmussen, M. D., Breuener, A., Hjort, C., Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2023, I: Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. 50, 1, 16 s., kuac028.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    4. Udgivet

      Progress and harmonization of gene editing to treat human diseases: Proceeding of COST Action CA21113 GenE-HumDi

      Cavazza, A., Hendel, A., Bak, R. O., Rio, P., Güell, M., Lainšček, D., Arechavala-Gomeza, V., Peng, L., Hapil, F. Z., Harvey, J., Ortega, F. G., Gonzalez-Martinez, C., Lederer, C. W., Mikkelsen, K., Gasiunas, G., Kalter, N., Gonçalves, M. A. F. V., Petersen, J., Garanto, A., Montoliu, L. & 20 flere, Maresca, M., Seemann, Ernst Stefan, Gorodkin, Jan, Mazini, L., Sanchez, R., Rodriguez-Madoz, J. R., Maldonado-Pérez, N., Laura, T., Schmueck-Henneresse, M., Maccalli, C., Grünewald, J., Carmona, G., Kachamakova-Trojanowska, N., Miccio, A., Martin, F., Turchiano, G., Cathomen, T., Luo, Y., Tsai, S. Q. & Benabdellah, K., 2023, I: Molecular Therapy Nucleic Acids. 34, 14 s., 102066.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › fagfællebedømt

    5. Udgivet

      RNA-Seq Study on the Longissimus thoracis Muscle of Italian Large White Pigs Fed Extruded Linseed with or without Antioxidants and Polyphenols

      Vegni, J., Sun, Y., Seemann, Ernst Stefan, Zappaterra, M., Davoli, R., Dall’Olio, S., Gorodkin, Jan & Zambonelli, P., 2023, I: Animals. 13, 7, 1187.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    6. Udgivet

      The transcriptomic landscape of neurons carrying PSEN1 mutations reveals changes in extracellular matrix components and non-coding gene expression

      Corsi, G. I., Gadekar, V. P., Haukedal, H., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Anthon, Christian, Ambardar, S., Palakodeti, D., Hyttel, P., Freude, Kristine, Seemann, Ernst Stefan & Gorodkin, Jan, 2023, I: Neurobiology of Disease. 178, 17 s., 105980.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    7. 2022
    8. Udgivet

      Single cell mapping the evolution of the spatial processing centre within the brain

      Ralbovszki, Dorottya Maria, Bertelsen, Mads Frost, Buchmann, Kurt, Mori, Yuki, Gorodkin, Jan, Hemberg, M., Seemann, Ernst Stefan, Khodosevich, Konstantin & Hall, Vanessa Jane, 1 maj 2022.

      Publikation: Konferencebidrag › Poster › Formidling

    9. Udgivet

      CRISPRroots: On-and off-target assessment of RNA-seq data in CRISPR-Cas9 edited cells

      Corsi, G. I., Gadekar, V. P., Gorodkin, Jan & Seemann, Ernst Stefan, 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 4, 12 s., E20.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    10. Udgivet

      Does rapid sequence divergence preclude RNA structure conservation in vertebrates?

      Seemann, Ernst Stefan, Mirza, A. H., Bang-Berthelsen, C. H., Garde, C., Christensen-Dalsgaard, M., Workman, C. T., Pociot, Flemming, Tommerup, Niels, Gorodkin, Jan & Ruzzo, W. L., 2022, I: Nucleic Acids Research. 50, 5, s. 2452-2463 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    11. Udgivet

      Flagella disruption in Bacillus subtilis increases amylase production yield

      Fehler, A. O., Kallehauge, T. B., Geissler, Adrian Sven, González-Tortuero, E., Seemann, Ernst Stefan, Gorodkin, Jan & Vinther, Jeppe, 2022, I: Microbial Cell Factories. 21, 11 s., 131.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    12. Udgivet

      Production of human entorhinal stellate cell-like cells by forward programming shows an important role of Foxp1 in reprogramming

      Bergmann, T., Liu, Y., Skov, J., Mogus, L., Lee, J., Pfisterer, U., Handfield, L. F., Asenjo-Martinez, A., Lisa-Vargas, I., Seemann, S. E., Lee, J. T. H., Patikas, N., Kornum, B. R., Denham, M., Hyttel, P., Witter, M. P., Gorodkin, J., Pers, T. H., Hemberg, M., Khodosevich, K. & 1 flere, Hall, Vanessa Jane, 2022, I: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 10, 976549.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    13. Udgivet

      The Bacillaceae-1 RNA motif comprises two distinct classes

      González-Tortuero, E., Anthon, Christian, Havgaard, Jakob Hull, Geissler, Adrian Sven, Breüner, A., Hjort, C., Gorodkin, Jan & Seemann, Ernst Stefan, 2022, I: Gene. 841, 146756.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    14. Udgivet

      The impact of PrsA over-expression on the Bacillus subtilis transcriptome during fed-batch fermentation of alpha-amylase production

      Geissler, Adrian Sven, Poulsen, L. D., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Anthon, Christian, Seemann, Ernst Stefan, González-Tortuero, E., Breüner, A., Jensen, Lars Juhl, Hjort, C., Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 17 s., 909493.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    15. 2021
    16. Udgivet

      Bsgatlas: A unified bacillus subtilis genome and transcriptome annotation atlas with enhanced information access

      Geissler, Adrian Sven, Anthon, Christian, Alkan, F., González-Tortuero, E., Poulsen, L. D., Kallehauge, T. B., Breüner, A., Seemann, Ernst Stefan, Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2021, I: Microbial Genomics. 7, 2, 17 s., 000524.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    17. Udgivet

      Development of the entorhinal cortex occurs via parallel lamination during neurogenesis

      Liu, Y., Bergmann, T., Mori, Yuki, Peralvo Vidal, Juan Miguel, Pihl, M., Vasistha, Navneet A, Thomsen, Preben Dybdahl, Seemann, Ernst Stefan, Gorodkin, Jan, Hyttel, P., Khodosevich, Konstantin, Witter, M. P. & Hall, Vanessa Jane, 2021, I: Frontiers in Neuroanatomy. 15, 19 s., 663667.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    18. Udgivet

      Modelling Nonalcoholic Steatohepatitis In Vivo—A Close Transcriptomic Similarity Supports the Guinea Pig Disease Model

      Skat-Rørdam, Josephine, Ipsen, David Højland, Seemann, Ernst Stefan, Latta, M., Lykkesfeldt, Jens & Tveden-Nyborg, Pernille, 2021, I: Biomedicines. 9, 9, 18 s., 1198.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    19. Udgivet

      RNAcentral 2021: Secondary structure integration, improved sequence search and new member databases

      Sweeney, B. A., Petrov, A. I., Ribas, C. E., Finn, R. D., Bateman, A., Szymanski, M., Karlowski, W. M., Seemann, S. E., Gorodkin, J., Cannone, J. J., Gutell, R. R., Kay, S., Marygold, S., Dos Santos, G., Frankish, A., Mudge, J. M., Barshir, R., Fishilevich, S., Chan, P. P., Lowe, T. M. & 26 flere, Seal, R., Bruford, E., Panni, S., Porras, P., Karagkouni, D., Hatzigeorgiou, A. G., Ma, L., Zhang, Z., Volders, P. J., Mestdagh, P., Griffiths-Jones, S., Fromm, B., Peterson, K. J., Kalvari, I., Nawrocki, E. P., Petrov, A. S., Weng, S., Bouchard-Bourelle, P., Scott, M., Lui, L. M., Hoksza, D., Lovering, R. C., Kramarz, B., Mani, P., Ramachandran, S. & Weinberg, Z., 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, D1, s. D212-D220

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    20. Udgivet

      The canine activated platelet secretome (CAPS): A translational model of thrombin-evoked platelet activation response

      Cremer, Signe Emilie, Catalfamo, J. L., Goggs, R., Seemann, Ernst Stefan, Kristensen, Annemarie T., Szklanna, P. B., Maguire, P. B. & Brooks, M. B., 2021, I: Research and Practice in Thrombosis and Haemostasis. 5, 1, s. 55-68

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    21. 2019
    22. Udgivet

      The developing Entorhinal cortex - a cellular map

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Pfisterer, U. G., Handfield, L., Asenjo Martinez, A., Seemann, Ernst Stefan, Witter, M., Khodosevich, Konstantin, Gorodkin, Jan, Hemberg, M., Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 25 nov. 2019. 1 s.

      Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Formidling

    23. Udgivet

      Production of stellate cells from induced pluripotent stem cells to study Alzheimer's disease pathology

      Mogus, L., Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Pfisterer, U. G., Handfield, L., Asenjo Martinez, A., Seemann, Ernst Stefan, Witter, M., Khodosevich, Konstantin, Gorodkin, Jan, Hemberg, M., Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 2019. 1 s.

      Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Formidling

    24. Udgivet

      Proteomic profiling of the thrombin-activated canine platelet secretome (CAPS)

      Cremer, Signe Emilie, Catalfamo, J. L., Goggs, R., Seemann, Ernst Stefan, Kristensen, Annemarie T. & Brooks, M. B., 2019, I: PLoS ONE. 14, 11, e0224891.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    25. Udgivet

      RNAcentral: a hub of information for non-coding RNA sequences

      The RNAcentral Constortium , T., Gorodkin, Jan & Seemann, Ernst Stefan, 2019, I: Nucleic Acids Research. 47, D1, s. D221–D229

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    26. Udgivet

      Sandwich cortial lamination and single-cell analysis decodes the developing spatial processing system

      Liu, Y., Bergmann, T. B., Lee, J., Pfisterer, U. G., Handfield, L-F., Mori, Y., Asenjo Martinez, A., Lisa Vargas, I., Seemann, E. S., Lee, J. T. H., Patikis, N., Peralvo Vidal, J. M., Pihl, M., Kornum, B. R., Thomsen, P. D., Hyttel, P., Witter, M., Khodosevich, K., Gorodkin, J., Hemberg, M. & 2 flere, Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 2019. 45 s.

      Publikation: Konferencebidrag › Paper › Formidling

    27. Udgivet

      The developing Entorhinal Cortex – a cellular map

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Pfisterer, U. G., Asenjo Martinez, A., Seemann, Ernst Stefan, Pihl, M., Thomsen, Preben Dybdahl, Hyttel, P., witter, M., Khodosevich, Konstantin, Gorodkin, Jan, Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 2019.

      Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

    28. Udgivet

      Uncovering the anatomical and molecular landscape of the starting point of Alzheimer’s disease in the brain

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Pfisterer, U. G., Asenjo Martinez, A., Seemann, Ernst Stefan, Pihl, M., Thomsen, Preben Dybdahl, Hyttel, P., witter, M., Khodosevich, Konstantin, Gorodkin, Jan, Pers, Tune H & Hall, Vanessa Jane, 2019.

      Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

    29. 2018
    30. Udgivet

      Multiple Sequence Alignments Enhance Boundary Definition of RNA Structures

      Sabarinathan, R., Anthon, Christian, Gorodkin, Jan & Seemann, Ernst Stefan, 4 dec. 2018, I: Genes. 9, 12, 17 s., 604.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    31. Udgivet

      Identification and characterization of novel conserved RNA structures in Drosophila

      Kirsch, Rebecca, Seemann, Ernst Stefan, Ruzzo, W. L., Cohen, S. M., Stadler, P. F. & Gorodkin, Jan, 2018, I: BMC Genomics. 19, 20 s., 899.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    32. Udgivet

      The developmental neurogenic niche of the Entorhinal cortex revealed by single-cell transcriptomics.

      Bergmann, T. B., Liu, Y., Lee, J., Peralvo Vidal, Juan Miguel, Mori, Yuki, Seemann, Ernst Stefan, Pihl, M., Thomsen, Preben Dybdahl, Hyttel, P., witter, M., Gorodkin, Jan, Hall, Vanessa Jane & Pers, Tune H, 2018.

      Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

    33. Udgivet

      Uncovering the anatomical and molecular landscape of the developing entorhinal cortex.

      Liu, Y., Bergmann, T. B., Peralvo Vidal, Juan Miguel, Lee, J., Mori, Yuki, Seemann, Ernst Stefan, Pihl, M., Thomsen, Preben Dybdahl, Gorodkin, Jan, Hyttel, P., Pers, Tune H, witter, M. & Hall, Vanessa Jane, 2018.

      Publikation: Konferencebidrag › Konferenceabstrakt til konference › Forskning

    34. 2017
    35. Udgivet

      DotAligner: Identification and clustering of RNA structure motifs

      Smith, M. A., Seemann, Ernst Stefan, Quek, X. C. & Mattick, J. S., dec. 2017, I: Genome Biology. 18, 1, 12 s., 244.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    36. Udgivet

      Associating transcription factors and conserved RNA structures with gene regulation in the human brain

      Hecker, N., Seemann, Ernst Stefan, Silahtaroglu, Asli, Ruzzo, W. L. & Gorodkin, Jan, 2017, I: Scientific Reports. 7, 1, 16 s., 5776.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    37. Udgivet

      RNAscClust: Clustering RNA sequences using structure conservation and graph based motifs

      Miladi, M., Junge, A., Costa, F., Seemann, Ernst Stefan, Havgaard, Jakob Hull, Gorodkin, Jan & Backofen, R., 2017, I: Bioinformatics. 33, 14, s. 2089-2096 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    38. Udgivet

      The identification and functional annotation of RNA structures conserved in vertebrates

      Seemann, Ernst Stefan, Mirza, A. H., Hansen, C., Bang-Berthelsen, C. H., Garde, C., Christensen-Dalsgaard, M., Torarinsson, E., Yao, Z., Workman, C. T., Pociot, Flemming, Nielsen, Henrik, Tommerup, Niels, Ruzzo, W. L. & Gorodkin, Jan, 2017, I: Genome Research. 27, s. 1371-1383 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    39. 2016
    40. Udgivet

      SNHG5 promotes colorectal cancer cell survival by counteracting STAU1-mediated mRNA destabilization

      Damas, N. D., Marcatti, M., Côme, Christophe Roger Michel, Christensen, L., Nielsen, M. M., Baumgartner, R., Gylling, H. M., Maglieri, G., Friis, Carsten, Seemann, Ernst Stefan, Rapin, N., Thézenas, S., Vang, S., Ørntoft, T., Andersen, C. L., Pedersen, J. S. & Lund, Anders H., 22 dec. 2016, I: Nature Communications. 7, 14 s., 13875.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    41. Udgivet

      Differential transcriptional responses to Ebola and Marburg virus infection in bat and human cells: [Plus] Corrigendum

      Hölzer, M., Krähling, V., Amman, F., Barth, E., Bernhart, S. H., Carmelo, V. A. O., Collatz, M., Doose, G., Eggenhofer, F., Ewald, J., Fallmann, J., Feldhahn, L. M., Fricke, M., Gebauer, J., Gruber, A. J., Hufsky, F., Indrischek, H., Kanton, S., Linde, J., Mostajo, N. & 19 flere, Ochsenreiter, R., Riege, K., Rivarola-Duarte, L., Sahyoun, A. H., Saunders, S. J., Seemann, Ernst Stefan, Tanzer, A., Vogel, B., Wehner, S., Wolfinger, M. T., Backofen, R., Gorodkin, Jan, Grosse, I., Hofacker, I., Hoffmann, S., Kaleta, C., Stadler, P. F., Becker, S. & Marz, M., 7 okt. 2016, I: Scientific Reports. 6, 16 s., 34589.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    42. 2015
    43. Udgivet

      Full-length RNA structure prediction of the HIV-1 genome reveals a conserved core domain

      Sükösd, Z., Andersen, E. S., Seemann, Ernst Stefan, Jensen, M. K., Hansen, M., Gorodkin, Jan & Kjems, J., 2 dec. 2015, I: Nucleic Acids Research. 43, 21, s. 10168-79 12 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    44. Udgivet

      Emerging tools for RNA structure analysis in polymorphic data

      Radhakrishnan, S., Seemann, Ernst Stefan & Gorodkin, Jan, 2015, I: Biozoom. 2, s. 10-13 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Formidling

    45. Udgivet

      Optimizing RNA structures by sequence extensions using RNAcop

      Hecker, N., Christensen-Dalsgaard, M., Seemann, Ernst Stefan, Havgaard, Jakob Hull, Stadler, P. F., Hofacker, I. L., Nielsen, Henrik & Gorodkin, Jan, 2015, I: Nucleic Acids Research. 43, 17, s. 8135-8145 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    46. Udgivet

      Quality Assessment of Domesticated Animal Genome Assemblies

      Seemann, Ernst Stefan, Anthon, Christian, Palasca, Oana & Gorodkin, Jan, 2015, I: Bioinformatics and Biology Insights. 9, Suppl 4, s. 49-58 10 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    47. Udgivet

      Transcriptomic landscape of lncRNAs in inflammatory bowel disease

      Mirza, A. H., Bang-Berthelsen, C. H., Seemann, Ernst Stefan, Pan, X., Frederiksen, K. S., Vilien, M., Gorodkin, Jan & Pociot, Flemming, 2015, I: Genome Medicine. 7, 22 s., 39.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    48. 2014
    49. Udgivet

      Structured RNAs and synteny regions in the pig genome

      Anthon, Christian, Tafer, H., Havgaard, Jakob Hull, Thomsen, B., Hedegaard, J., Seemann, Ernst Stefan, Pundhir, Sachin, Kehr, S., Bartschat, S., Nielsen, M., Nielsen, R. O., Fredholm, Merete, Stadler, P. F. & Gorodkin, Jan, 2014, I: BMC Genomics. 15, 27 s., 459.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    50. 2013
    51. Udgivet

      RNAsnp: efficient detection of local RNA secondary structure changes induced by SNPs: efficient detection of local RNA secondary structure changes induced by SNPs

      Radhakrishnan, S., Tafer, H., Seemann, Ernst Stefan, Hofacker, I. L., Stadler, P. F. & Gorodkin, Jan, 2013, I: Human Mutation. 34, 4, s. 546-556 11 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    52. Udgivet

      The RNAsnp web server: predicting SNP effects on local RNA secondary structure

      Radhakrishnan, S., Tafer, H., Seemann, Ernst Stefan, Hofacker, I. L., Stadler, P. F. & Gorodkin, Jan, 2013, I: Nucleic Acids Research. 41, s. W475-W479 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    53. 2012
    54. Udgivet

      Sequence and expression analysis of gaps in human chromosome 20

      Minocherhomji, S., Seemann, Ernst Stefan, Mang, Y., Elschich, Z., Bak, M., Hansen, C., Papadopoulos, N., Josefsen, K., Nielsen, Henrik, Gorodkin, Jan, Tommerup, Niels & Silahtaroglu, Asli, aug. 2012, I: Nucleic Acids Research. 40, 14, s. 6660-6672 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    55. Udgivet

      RILogo: visualising RNA-RNA interactions

      Menzel, K. P., Seemann, Ernst Stefan & Gorodkin, Jan, 2012, I: Bioinformatics. 28, 19, s. 2523-2526 4 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    56. Udgivet

      Transcripts with in silico predicted RNA structure are enriched everywhere in the mouse brain

      Seemann, Ernst Stefan, Sunkin, S. M., Hawrylycz, M. J., Ruzzo, W. L. & Gorodkin, Jan, 2012, I: BMC Genomics. 13, 1, s. 214-227 14 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    57. 2011
    58. Udgivet

      PETcofold: predicting conserved interactions and structures of two multiple alignments of RNA sequences

      Seemann, Ernst Stefan, Richter, A. S., Gesell, T., Backofen, R. & Gorodkin, Jan, 2011, I: Bioinformatics. 27, 2, s. 211-219 9 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    59. Udgivet

      The PETfold and PETcofold web servers for intra- and intermolecular structures of multiple RNA sequences

      Seemann, Ernst Stefan, Menzel, K. P., Backofen, R. & Gorodkin, Jan, 2011, I: Nucleic Acids Research. 39, Suppl. 2, s. W107-W111 5 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    60. 2010
    61. Udgivet

      Hierarchical folding of multiple sequence alignments for the prediction of structures and RNA-RNA interactions

      Seemann, Ernst Stefan, Richter, A. S., Gorodkin, Jan & Backofen, R., 2010, I: Algorithms for Molecular Biology. 5, 22, 13 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    62. Udgivet

      Prediction of structured non-coding RNAs, RNA-RNA interactions and their (co)-expression in the brain

      Seemann, Ernst Stefan, 2010, Department of Basic Animal and Veterinary Sciences, University of Copenhagen. 195 s.

      Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning

    63. 2008
    64. Udgivet

      Unifying evolutionary and thermodynamic information for RNA folding of multiple alignments

      Seemann, Ernst Stefan, Gorodkin, Jan & Backofen, R., 2008, I: Nucleic Acids Research. 36, 20, s. 6355-6362 8 s.

      Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › fagfællebedømt

    Forrige 1 2 Næste

    ID: 4223622