Christian Anthon

Christian Anthon

Systemadministrator


  1. 2023
  2. Udgivet

    CRISPRi screen for enhancing heterologous alpha-amylase yield in Bacillus subtilis

    Geissler, Adrian Sven, Fehler, A. O., Poulsen, L. D., Gonzalez-Tortuero, E., Kallehauge, T. B., Alkan, F., Anthon, Christian, Seemann, Ernst Stefan, Rasmussen, M. D., Breuener, A., Hjort, C., Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2023, I: Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. 50, 1, 16 s., kuac028.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Cross-species high-resolution transcriptome profiling suggests biomarkers and therapeutic targets for ulcerative colitis

    Yarani, R., Palasca, Oana, Doncheva, Nadezhda Tsankova, Anthon, Christian, Pilecki, B., Svane, C. A. S., Mirza, A. H., Litman, Thomas, Holmskov, U., Bang-Berthelsen, C. H., Vilien, M., Jensen, Lars Juhl, Gorodkin, Jan & Pociot, Flemming, 2023, I: Frontiers in Molecular Biosciences. 9, 1081176.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    Letter to the editor: Testing on external independent datasets is necessary to corroborate machine learning model improvement

    Corsi, G. I., Anthon, Christian & Gorodkin, Jan, 2023, I: Bioinformatics. 39, 6, btad327.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    The transcriptomic landscape of neurons carrying PSEN1 mutations reveals changes in extracellular matrix components and non-coding gene expression

    Corsi, G. I., Gadekar, V. P., Haukedal, H., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Anthon, Christian, Ambardar, S., Palakodeti, D., Hyttel, P., Freude, Kristine, Seemann, Ernst Stefan & Gorodkin, Jan, 2023, I: Neurobiology of Disease. 178, 17 s., 105980.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. 2022
  7. Udgivet

    CRISPRon/off: CRISPR/Cas9 on- and off-target gRNA design

    Anthon, Christian, Corsi, G. I. & Gorodkin, Jan, 2022, I: Bioinformatics. 38, 24, s. 5437-5439 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Massively targeted evaluation of therapeutic CRISPR off-targets in cells

    Pan, X., Qu, K., Yuan, H., Xiang, X., Anthon, C., Pashkova, L., Liang, X., Han, P., Corsi, G. I., Xu, F., Liu, P., Zhong, J., Zhou, Y., Ma, T., Jiang, H., Liu, J., Wang, J., Jessen, N., Bolund, L., Yang, H. & 5 flere, Xu, X., Church, G. M., Gorodkin, Jan, Lin, L. & Luo, Y., 2022, I: Nature Communications. 13, 14 s., 4049.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    The Bacillaceae-1 RNA motif comprises two distinct classes

    González-Tortuero, E., Anthon, Christian, Havgaard, Jakob Hull, Geissler, Adrian Sven, Breüner, A., Hjort, C., Gorodkin, Jan & Seemann, Ernst Stefan, 2022, I: Gene. 841, 146756.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    The impact of PrsA over-expression on the Bacillus subtilis transcriptome during fed-batch fermentation of alpha-amylase production

    Geissler, Adrian Sven, Poulsen, L. D., Doncheva, Nadezhda Tsankova, Anthon, Christian, Seemann, Ernst Stefan, González-Tortuero, E., Breüner, A., Jensen, Lars Juhl, Hjort, C., Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2022, I: Frontiers in Microbiology. 13, 17 s., 909493.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. 2021
  12. Udgivet

    Bsgatlas: A unified bacillus subtilis genome and transcriptome annotation atlas with enhanced information access

    Geissler, Adrian Sven, Anthon, Christian, Alkan, F., González-Tortuero, E., Poulsen, L. D., Kallehauge, T. B., Breüner, A., Seemann, Ernst Stefan, Vinther, Jeppe & Gorodkin, Jan, 2021, I: Microbial Genomics. 7, 2, 17 s., 000524.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Enhancing CRISPR-Cas9 gRNA efficiency prediction by data integration and deep learning

    Xiang, X., Corsi, G. I., Anthon, C., Qu, K., Pan, X., Liang, X., Han, P., Dong, Z., Liu, L., Zhong, J., Ma, T., Wang, J., Zhang, X., Jiang, H., Xu, F., Liu, X., Xu, X., Wang, J., Yang, H., Bolund, L. & 4 flere, Church, G. M., Lin, L., Gorodkin, Jan & Luo, Y., 2021, I: Nature Communications. 12, 1, 9 s., 3238.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Human pathways in animal models: possibilities and limitations

    Doncheva, Nadezhda Tsankova, Palasca, Oana, Yarani, R., Litman, Thomas, Anthon, Christian, Groenen, M. A. M., Stadler, P. F., Pociot, Flemming, Jensen, Lars Juhl & Gorodkin, Jan, 2021, I: Nucleic Acids Research. 49, 4, s. 1859-1871 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Novel circRNA discovery in sheep shows evidence of high backsplice junction conservation

    Varela-Martínez, E., Corsi, G. I., Anthon, Christian, Gorodkin, Jan & Jugo, B. M., 2021, I: Scientific Reports. 11, 1, 11 s., 427.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. 2019
  17. Udgivet

    Epigenetic and Transcriptomic Characterization of Pure Adipocyte Fractions From Obese Pigs Identifies Candidate Pathways Controlling Metabolism

    Jacobsen, M. J., Havgaard, Jakob Hull, Anthon, Christian, Mentzel, Caroline M. Junker, Cirera, Susanna, Krogh, P. M., Pundhir, Sachin, Karlskov-Mortensen, Peter, Bruun, C. S., Lesnik, P., Guerin, M., Gorodkin, Jan, Jørgensen, Claus Bøttcher, Fredholm, Merete & Barrès, Romain, 2019, I: Frontiers in Genetics. 10, 13 s., 1268.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Transcriptome landscape of protein-coding genes and long noncoding RNAs in the colon and blood of DSS-induced mouse model of Acute ulcerative colitis

    Yarani, R., Palasca, Oana, Doncheva, Nadezhda Tsankova, Anthon, Christian, Pilecki, B., Litman, Thomas, Holmskov, U., Jensen, Lars Juhl, Gorodkin, Jan & Pociot, Flemming, 2019, I: Journal of Crohn's and Colitis. 13, s. S129-S130

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  19. 2018
  20. Udgivet

    Multiple Sequence Alignments Enhance Boundary Definition of RNA Structures

    Sabarinathan, R., Anthon, Christian, Gorodkin, Jan & Seemann, Ernst Stefan, 4 dec. 2018, I: Genes. 9, 12, 17 s., 604.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    WebCircRNA: Classifying the Circular RNA Potential of Coding and Noncoding RNA.

    Pan, X., Xiong, K., Anthon, Christian, Hyttel, P., Freude, Kristine, Jensen, Lars Juhl & Gorodkin, Jan, 6 nov. 2018, I: Genes. 9, 11, 11 s., 536.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    CRISPR-Cas9 off-targeting assessment with nucleic acid duplex energy parameters

    Alkan, F., Wenzel, Anne, Anthon, Christian, Havgaard, Jakob Hull & Gorodkin, Jan, 2018, I: Genome Biology. 19, 13 s., 177.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    IFN-λ and microRNAs are important modulators of the pulmonary innate immune response against influenza A (H1N2) infection in pigs

    Brogaard, L., Larsen, Lars, Heegaard, P. M. H., Anthon, Christian, Gorodkin, Jan, Dürrwald, R. & Skovgaard, K., 2018, I: PLOS ONE. 13, 4, 23 s., e0194765.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. 2017
  25. Udgivet

    RAIN: RNA-protein Association and Interaction Networks

    Junge, A., Refsgaard, J. C., Garde, C., Pan, X., Santos, A., Alkan, F., Anthon, Christian, von Mering, C., Workman, C. T., Jensen, Lars Juhl & Gorodkin, Jan, 2017, I: Database: The Journal of Biological Databases and Curation. 2017, 9 s., baw167.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. 2016
  27. Udgivet

    Adipocyte gene expression and DNA methylation patterns differ significantly between lean and obese pigs

    Jacobsen, M. J., Havgaard, Jakob Hull, Mentzel, Caroline M. Junker, Sørensen, P. M., Pundhir, Sachin, Anthon, Christian, Karlskov-Mortensen, Peter, Bruun, Camilla Vibeke Sichlau, Cirera, Susanna, Gorodkin, Jan, Jørgensen, Claus Bøttcher, Barrès, Romain & Fredholm, Merete, 9 nov. 2016, I: Journal of Animal Science. 94, Supplement 4, s. 46-47 2 s., P2019.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceabstrakt i tidsskriftForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Tools and data services registry: a community effort to document bioinformatics resources

    Ison, J., Rapacki, K., Ménager, H., Kalaš, M., Rydza, E., Chmura, P., Anthon, C., Beard, N., Berka, K., Bolser, D., Booth, T., Bretaudeau, A., Brezovsky, J., Casadio, R., Cesareni, G., Coppens, F., Cornell, M., Cuccuru, G., Davidsen, K., Vedova, G. D. & 49 flere, Dogan, T., Doppelt-Azeroual, O., Emery, L., Gasteiger, E., Gatter, T., Goldberg, T., Grosjean, M., Grüning, B., Helmer-Citterich, M., Ienasescu, H., Ioannidis, V., Jespersen, M. C., Jimenez, R., Juty, N., Juvan, P., Koch, M., Laibe, C., Li, J., Licata, L., Mareuil, F., Mičetić, I., Friborg, R. M., Moretti, S., Morris, C., Möller, S., Nenadic, A., Peterson, H., Profiti, G., Rice, P., Romano, P., Roncaglia, P., Saidi, R., Schafferhans, A., Schwämmle, V., Smith, C., Sperotto, M. M., Stockinger, H., Vařeková, R. S., Tosatto, S. C. E., de la Torre, V., Uva, P., Via, A., Yachdav, G., Zambelli, F., Vriend, G., Rost, B., Parkinson, H., Løngreen, P. & Brunak, Søren, 2016, I: Nucleic Acids Research. 44, D1, s. D38-D47 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. 2015
  30. Udgivet

    Gender and obesity specific MicroRNA expression in adipose tissue from lean and obese pigs

    Mentzel, Caroline M. Junker, Anthon, Christian, Jacobsen, M. J., Karlskov-Mortensen, Peter, Bruun, Camilla Vibeke Sichlau, Jørgensen, Claus Bøttcher, Gorodkin, Jan, Cirera, Susanna & Fredholm, Merete, 29 jul. 2015, I: P L o S One. 10, 7, 19 s., e0131650.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Quality Assessment of Domesticated Animal Genome Assemblies

    Seemann, Ernst Stefan, Anthon, Christian, Palasca, Oana & Gorodkin, Jan, 2015, I: Bioinformatics and Biology Insights. 9, Suppl 4, s. 49-58 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    RNA 3D modules in genome-wide predictions of RNA 2D structure

    Theis, C., Zirbel, C. L., Zu Siederdissen, C. H., Anthon, Christian, Hofacker, I. L., Nielsen, Henrik & Gorodkin, Jan, 2015, I: PLOS ONE. 10, 10, 13 s., e0139900.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. 2014
  34. Udgivet

    Structured RNAs and synteny regions in the pig genome

    Anthon, Christian, Tafer, H., Havgaard, Jakob Hull, Thomsen, B., Hedegaard, J., Seemann, Ernst Stefan, Pundhir, Sachin, Kehr, S., Bartschat, S., Nielsen, M., Nielsen, R. O., Fredholm, Merete, Stadler, P. F. & Gorodkin, Jan, 2014, I: BMC Genomics. 15, 27 s., 459.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. 2012
  36. Udgivet

    Profiling microRNAs in lung tissue from pigs infected with Actinobacillus pleuropneumoniae

    Podolska, A., Anthon, Christian, Bak, M., Tommerup, Niels, Skovgaard, K., Heegaard, P. M., Gorodkin, Jan, Cirera, S. & Fredholm, Merete, sep. 2012, I: B M C Genomics. 13, 1, s. 459

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Analyses of pig genomes provide insight into porcine demography and evolution

    Groenen, M. A., Archibald, A. L., Uenishi, H., Tuggle, C. K., Takeuchi, Y., Rothschild, M. F., Rogel-Gaillard, C., Park, C., Milan, D., Megens, H-J., Li, S., Larkin, D. M., Kim, H., Frantz, L. A. F., Caccamo, M., Ahn, H., Aken, B. L., Anselmo, A., Anthon, C., Auvil, L. & 116 flere, Badaoui, B., Beattie, C. W., Bendixen, C., Berman, D., Blecha, F., Blomberg, J., Bolund, L., Bosse, M., Botti, S., Zhan, B., Bystrom, M., Capitanu, B., Carvalho-Silva, D., Chardon, P., Chen, C., Cheng, R., Choi, S., Chow, W., Clark, R. C., Clee, C., Crooijmans, R. P. M. A., Dawson, H. D., Dehais, P., Sapio, F. D., Dibbits, B., Drou, N., Du, Z., Eversole, K., Fadista, J., Fairley, S., Faraut, T., Faulkner, G. J., Fowler, K. E., Fredholm, Merete, Fritz, E., Gilbert, J. G. R., Giuffra, E., Gorodkin, Jan, Griffin, D. K., Harrow, J. L., Hayward, A., Howe, K., Hu, Z., Humphray, S. J., Hunt, T., Jensen, H. H., Jeon, J., Jern, P., Jones, M., Jurka, J., Kanamori, H., Kapetanovic, R., Kim, J., Kim, J., Kim, K., Kim, T., Larson, G., Lee, K., Lee, K., Leggett, R., Lewin, H. A., Li, Y., Liu, W., Loveland, J. E., Lu, Y., Lunney, J. K., Ma, J., Madsen, O., Mann, K., Matthews, L., McLaren, S., Morozumi, T., Murtaugh, M. P., Narayan, J., Nguyen, D. T., Ni, P., Oh, S., Onteru, S., Panitz, F., Park, E., Park, H., Pascal, G., Paudel, Y., Perez-Enciso, M., Ramirez-Gonzalez, R., Reecy, J. M., Rodriguez-Zas, S., Rohrer, G. A., Rund, L., Sang, Y., Schachtschneider, K., Schraiber, J. G., Schwartz, J., Scobie, L., Scott, C., Searle, S., Servin, B., Southey, B. R., Sperber, G., Stadler, P., Sweedler, J. V., Tafer, H., Thomsen, B., Wali, R., Wang, J., Wang, J., White, S., Xu, X., Yerke, M., Zhang, G., Zhang, J., Zhang, J., Zhao, S., Rogers, J., Churcher, C. & Schook, L. B., 2012, I: Nature. 491, 7424, s. 393-398 6 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  38. 2011
  39. Udgivet

    Heterobimetallic Nitride Complexes from Terminal Chromium(V) Nitride Complexes: Hyperfine Coupling Increases with Distance

    Bendix, Jesper, Anthon, Christian, Schau-Magnussen, M., Brock-Nannestad, Theis, Vibenholt, J., Rehman, M. & Sauer, Stephan P. A., 6 apr. 2011, I: Angewandte Chemie International Edition. 50, 19, s. 4480-4483

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. 2010
  41. Udgivet

    Synthesis and mol-ecular structure of Cr(salen)(μ-N)RhCl(COD): The first example of a heterobimetallic nitride-bridged complex containing chromium

    Vibenholt, J., Magnussen, M., Anthon, Christian & Bendix, Jesper, 16 jul. 2010, I: Acta Crystallographica Section C: Crystal Structure Communications. 66, 7, s. m177-m179 3 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

ID: 20429016